对于很小的虹膜黑色素性肿瘤可以定期密切观察。对于生长较快的患者，可行肿瘤局部切除术。病变范围不大，肿瘤未累及虹膜角膜角者则行节段性虹膜切除术。仅累及小梁网者，可行虹膜小梁切除术。睫状体受累者，则行虹膜睫状体切除术。

对于弥漫性或病变范围超过5个钟点，或继发青光眼视功能已丧失，则考虑行眼球摘除术。